
NVIDIA Tesla K80 GPU 如何助力分析打结蛋白质的折叠过程?
在通过马尔可夫模型研究打结蛋白的变化通路的过程当中,需要对初始通路附近,以及可行域空间中的可能初始构象进行大量的采样,只有足够多的分子构象才能给分析过程带来可靠的信息,传统的基于 CPU 的分子动力学模拟是非常耗时的,并行效率低,得到的构象不足以通过马尔可夫模型进行分析,我们利用 NVIDIA 的 TESLA K80 GPU 加速了这一采样过程,并实现了分布式的加速。
以全原子 Go 模型为主要研究方法,通过对三叶结蛋白质的分子动力学模拟,得到大量三叶结蛋白质
阅读全文 → 2022-12-19